Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms