Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms