Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms