Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms