Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L3Q6VB84 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms