Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBR1LQ6UX01 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms