Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
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