Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms