Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms