Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM6

TYW1B, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW1BQ6NUM6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TYW1BQ6NUM6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW1BQ6NUM6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms