Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms