Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LEMD1Q68G75 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LEMD1Q68G75 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms