Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms