Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD4Q5VX71 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms