Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms