Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms