Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms