Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms