Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47AQ5JRC9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms