Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms