Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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