Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms