Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms