Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms