Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms