Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPROQ16827 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPROQ16827 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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PTPROQ16827 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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PTPROQ16827 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPROQ16827 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPROQ16827 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPROQ16827 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPROQ16827 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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