Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME3Q16798 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms