Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
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