Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RPE65Q16518 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RPE65Q16518 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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