Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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CHD4Q14839 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD4Q14839 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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