Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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