Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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