Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCINQ13939 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CCINQ13939 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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CCINQ13939 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CCINQ13939 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CCINQ13939 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CCINQ13939 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCINQ13939 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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