Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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