Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms