Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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