Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms