Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FHL3Q13643 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms