Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTCH1Q13635 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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