Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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