Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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