Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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AP3B2Q13367 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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