Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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