Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SEMA3FQ13275 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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SEMA3FQ13275 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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SEMA3FQ13275 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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SEMA3FQ13275 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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SEMA3FQ13275 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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