Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPPAQ13219 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms