Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CALCOCO2Q13137 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CALCOCO2Q13137 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CALCOCO2Q13137 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CALCOCO2Q13137 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CALCOCO2Q13137 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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