Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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