Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP53BP1Q12888 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms