Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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