Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TROQ12816 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TROQ12816 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TROQ12816 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TROQ12816 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TROQ12816 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TROQ12816 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TROQ12816 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TROQ12816 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TROQ12816 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TROQ12816 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TROQ12816 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms